宫腔镜顾名思义是借助在宫腔内操作的手术，因此一些发生在宫腔内的病变可以在宫腔镜下处理，具体来看，可以分为如下几类：
1. 非自身的异物：主要与妊娠相关，也有些是宫内避孕装置。妊娠物从宫腔内排出主要靠子宫的收缩，但也有通过刮宫手术清除的。如果发生残留，就可以通过宫腔镜处理，在直视下操作，减少对子宫腔的损伤。有一些极端的情况，比如胚胎种植在剖宫产的疤痕或者子宫角内，常常选择直接用宫腔镜清除妊娠物。另外，宫内节育器如果发生嵌顿或者断裂，也往往需要借助宫腔镜取出。
2. 子宫内膜的病变：最常见的子宫内膜病变是息肉，就是部分内膜增生后形成像蘑菇样的突起，可能与异常的出血有关。还有些是内膜过分增生，出现结构异常或细胞异形，称为子宫内膜增生症，也需要宫腔镜来检验药物治疗的效果。另外一种子宫内膜损伤而导致的疾病，表现为部分或全部的宫腔封闭，即宫腔粘连，也需要宫腔镜进行分离。
3. 子宫肌层的病变：子宫肌层位于子宫内膜下方，如果肌层贴近内膜的肌层发生病变就可以向宫腔内突起，并影响月经或引起出血。最常见的是子宫肌瘤，这种特殊类型的肌瘤就称为粘膜下子宫肌瘤，可能会对怀孕造成影响。还有贴近内膜的子宫腺肌病，可以在宫腔镜下手术。与腹腔镜比较，宫腔镜的好处在于，损伤小，术后避孕时间大大缩短。当然一些类型的子宫畸形也需要在宫腔镜下处理，比如纵隔子宫，在宫腔镜发明之前，治疗它必须打开子宫，损伤巨大，而现在仅需在镜下将功能异常的隔膜切开即可，相当便捷快速。